Studentverslag
Robbert de Vries
Torrey Pines Institue for Molecular Studies
San Diego California USA
Januari-Augustus

Motivatie
Tijdens mijn stage op de afdeling Experimentele Virologie aan het AMC onder supervisie van Dr. Rogier Sanders werd mijn interesse in Biomedisch onderzoek stevig aangewakkerd. Ik was daar bezig de immunogeniciteit van het HIV envelop eiwit te vergroten. Dit eiwit vond ik naarmate mijn stage vorderde steeds interessanter worden en ik wou er dan ook in mijn tweede graag verder aan werken. Ondertussen had ik collega’s al ingelicht dat ik ook wel graag naar het buitenland wilde.  Na enige tijd bood Rogier Sanders mij een aan om deze bij een vriend van hem te doen in La Jolla California. Hierover heb ik geen moment getwijfeld en na een ontmoeting op de Aids Vaccine meeting in Amsterdam en wat mailtjes konden de voorbereiding begonnen worden.

Onderzoek
Mijn onderzoek heb ik verricht op het Torrey Pines Institute for Molecular Studies, dit instituut huurt drie gangen op het Generaal Atomics complex net achter de University of California San Diego en tegenover het Scripps research institute. Een geweldige locatie zo midden in een epicentrum van biomedisch onderzoek. Echter bleek ik wel de enige student te zijn op dit instituut, en aangezien veel collega’s Chinees waren was er niet zo heel veel aanspraak en of begeleiding, wel werd er intensief samen gewerkt met het lab van Dr. Burton op het Scripps.
Mijn begeleider James Binley is voornamelijk bekend door zijn onderzoek naar humane monoklonale antilichamen tegen HIV. Ik ging onder zijn supervisie aan de slag met HIV Virus-like Particles (VLPs) om hiermee uit patiënten libraries op zoek te gaan naar nieuwe neutraliserende antilichamen. De huidige techniek om dit te doen maakt gebruik van een gedeelte van het HIV Envelop eiwit en dit selecteert eigenlijk voor niet-neutraliserende antilichamen. Maar met de VLPs was het mogelijk om dit te doen met het gehele natuurlijke Envelop complex.
Ik heb tijdens de 6 maanden twee toepassingen ontwikkeld om nieuwe antilichamen te vinden, ten eerste heb ik een systeem ontwikkeld om het functionele Env complex op VLPs te gebruiken in phage display experimenten. Dit heb ik gedaan met het idee dat VLPs een pellet vormen na centrifugeren en phages niet. Zodoende kan je phages die binden aan VLPs scheiden van niet bindende phages. Verder was het belangrijk om niet belangrijke epitopen op deze VLPs (die ook Env subunits dragen) te blokken met bijvoorbeeld antilichamen of serum die deze bevatten. Een andere toepassing was het creëren van polyclonale Fab libraries uit phages libraries. Door het genIII eruit te knippen, ligeren en transfomeren kan je op een agar plaat zo’n library representeren. De kolonies op de agar platen kan je gebruiken om Fabs te maken en deze te screen op een eiwit gel, antilichamen die het natuurlijk env complex binden zullen een shift in veroorzaken wat correleert aan neutralisatie.

San Diego
San Diego is vooral bekend om zijn klimaat, het is hier het gehele jaar door 20 graden of warmer. La Jolla is een van de prachtigste gebieden waar ik ben geweest en Pacific Beach wat daaronder ligt is een groot feest. Op dat strand mag alcohol genuttigd worden, als een van de enige in Amerika, waardoor het hier bijna elk weekend Spring Break leek.
De University van California San Diego oefent een ontzettend grote aantrekkingskracht uit op vele studenten van de hele wereld. En ook omdat het biomedisch onderzoek vele nationaliteiten waarborgt is San Diego ontzettend werelds te noemen. Er kijkt niemand op als je uit Europa komt, al krijg je gelijk een plus als je een Amsterdammer bent.
Ik heb werkelijk waar genoten en ontzettend veel geleerd op biomedisch en sociaal gebied. Er wordt op een heel andere manier gewerkt, en mensen kijken zo anders tegen de wereld dan wij dat in Nederland doen. Ik raad dan ook eigelijk elke student aan een tijd een in het buitenland te werken of te studeren.   
Mijn wetenschappelijke carriere ga ik voortzetten aan de Universiteit van Utrecht op de faculteit diergeneeskunde. Hier op de afdeling Virolgie ga ik het envelope eiwit van influenza virus karakteriseren.
Verder wil ik de Dr. Saal van Zwanenberg stichting ontzettend bedanken om dit project voor mij mogelijk te maken.